Bažnyčios ir kaimo istorija glaudžiai susijusi su bajorų Žilinskų gimine. Klasicizmo epochos spindulys dzūkų giriose, Vilniaus universiteto auklėtinio architekto Karolio Gregotovičiaus projektuota Nedzingės bažnyčia primena antikinę šventovę. Galima sakyti, jog tai Žilinskų giminės mauzoliejus.